水母湖（当地称为Ongeim'l Tketau）长约450米，宽约160米，因地壳运动在大约1.2万年前与海洋脱离，该湖通过石灰岩的裂缝与海洋相通，湖水微咸，分为两层：上层富含氧气，可供动物生存；15米以下的深度完全没有氧气，只有微生物。
水母湖里主要有两种水母：金色水母（巴布亚硝水母Mastigias papua）和海月水母（Aurelia sp.）。在数千年的隔绝生活中，这些水母几乎彻底失去了刺细胞，所以在这些水母中间游泳成了受游客喜欢的娱乐活动。湖中的水母每天会沿固定的路线转移，所以很容易观察它们。
2018年12月15日, 02:42
据估计，湖中水母数量原有2000万只，但厄尔尼诺现象期间急遽升温的湖水使得生活在水母体内的共生藻大量死亡，这些共生藻是水母养分的重要来源，因而导致水母死亡。防晒霜里的化学物质污染湖水，也是水母死亡的原因之一。
现在，世界珊瑚礁普查基金会的生物学家沙龙·帕特里斯（Sharon Patris）称，水母种群已部分恢复，数量现在达到500-800万只。沙龙·帕特里斯还称，并未证实防晒霜与水母数量减少之间有关系。不过保护湖水不受污染的措施将加强。游客将只被允许使用特定的防晒霜，往身体上涂防晒霜的时间应不晚于下水前半小时。潜水前所有衣物应被仔细清洗，以便将外来物种带入湖中。
埃尔马尔克岛和邻近岛屿上还有几十个有水母的咸水湖，但只有一个湖对潜水者开放。埃尔马尔克岛所属的科罗尔州立法议会现在正在考虑将参观水母湖的费用从100美元增加到150美元的提议。
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