9月13日，德国巡防舰“巴登符腾堡号”与补给舰“法兰克福号”按原定计划穿越台湾海峡。这是德海军22年来首次通过台海。德国总理朔尔茨声称，“台海是国际水域，强调此举符合国际法”。
胡春春称：“首先这件事情性质比较恶劣，其次也不让人感到意外。性质恶劣之处在于，目前德国政府基本上完全跟随美国的涉华立场。而美国的立场众所周知，对华不断采取非理性的、充满敌意的政策。而且自由航行本身从来不是问题，但是军舰的自由航行恐怕还需要打上一个问号，特别是在涉及中国内政和核心利益的问题上。无论是重复美国的话术还是选择航行的时间点，德国政府的行为相当于是置中国核心利益于不顾。”
专家指出，实际上不难看出，当前德国的对华政策充满相互矛盾、左右互搏之处，可以说本届三党联合政府的对华政策整体上处于功能失调的状态。而此次事件就是这种功能性失调的一个更为明显的例子，除了将西方和其他地区出现的地缘政治紧张或冲突归咎于没有直接参与的中国外，德国所采取的对华政策也日趋靠向美国。至于这种行为对于欧洲战略自主的诉求是否能产生促进作用，可能同样需要打上一个问号。
“德国对华政策功能性失调最明显的一个特点就是，不同政党、不同领域和不同政治家在对华问题上无法协调，甚至没有能力协调。正如西方对中国的定义，‘既是合作伙伴，又是竞争对手，同时也是制度性对手’的表述一定程度上已经能够体现出政策的功能性失调。”胡春春表示。
在专家看来，虽然德国的政治总体上比较中性和审慎，但经常也会因利益出现摇摆。换言之，德国的立场不够明晰，一会儿想在这方面追求利益最大化，一会儿又想在另一方面追求利益最大化。再加上德国战略自主性不强，导致容易在外部压力和内部博弈之下在不同立场之间左右摇摆。
中国驻德国大使馆已向德方提出交涉表明严正立场。使馆称，中方再次重申，台湾是中国领土不可分割的一部分。台湾问题不是什么“航行自由”问题，而是事关中国主权和领土完整的问题。中方尊重各国依据中国法律和包括《联合国海洋法公约》在内的国际法在相关海域享有的航行权利，但坚决反对他国打着航行自由的旗号，挑衅、危害中方主权和安全。
中国国防部发言人吴谦大校9月14日回应称，中国人民解放军东部战区组织海空兵力对德舰全程跟监警戒。中国军队时刻保持高度戒备，采取有力措施挫败一切挑衅图谋，坚决捍卫国家主权和领土完整，坚决维护台海和平稳定。