萧旭岑介绍，访问团搭乘南方航空CZ-3088班机，于4月1日下午抵达深圳宝安国际机场，预计在广东停留3天，除了参访中山大学与师生交流外，还会瞻仰黄花岗七十二烈士陵园、参观孙中山先生故居纪念馆与黄埔军校旧址纪念馆，以及参观大疆公司、腾讯公司、比亚迪公司及港珠澳大桥，预计4月3日晚间抵达陕西。
萧旭岑表示，4月4日上午，马英九将率全团参加“清明公祭轩辕黄帝典礼”，并预计在陕西停留4天。除了参观秦始皇帝陵博物院、法门寺、大慈恩寺（大雁塔）、陕西历史博物馆及西安国家版本馆，也将参访杨凌智慧农业示范园、隆基绿能科技股份有限公司，并前往马援祠及马援墓寻根。
萧旭岑说，访团预计4月7日下午抵达北京，展开此行第三站的访问。在北京期间，除了前往北京大学参访交流外，也会参观八达岭长城、北京故宫、中国空间技术研究院及卢沟桥和中国人民抗日战争纪念馆，另外还将参观奥林匹克公园内的“冰丝带”（国家速滑馆）及“鸟巢”（国家体育场）。4月11日上午，全团搭乘中国国际航空CA-185班机，由北京首都国际机场飞返台湾，结束此次参访行程。
萧旭岑表示，此行最重要是延续去年开始的两岸青年学子交流，让两岸民间敌意减缓，避免未来走向冲突。马英九也期盼通过这次访问大陆，推动两岸更多交流，促进两岸民众福祉，同时也有助于稳定两岸关系与区域紧张情势。
台湾媒体此前引述消息人士的话称，习近平与马英九将在4月8日会面。