关于马英九访问大陆的消息释出后，便有媒体“披露”了马英九一行的具体行程。对此，马英九基金会执行长萧旭岑3月26日回应称，行程尚在安排中，目前并未定案，不知（具体行程）消息从何而来。
萧旭岑表示，在2015年“习马会”后，两岸关系就进入比较冷、紧张的形式，因为蔡英文上任后不承认九二共识，而赖清德即将接任台湾地区领导人，这时若有机会到北京去，一别九年，“马英九当然会希望能与老朋友碰面”，不过客随主便，一切尊重陆方安排。
萧旭岑表示，马英九卸任台湾地区领导人已有8年，目前也没有党职、公职，就是一般老百姓。他说，马英九此行希望传达台湾民众的心声，台湾民众是爱好和平、反对战争的。希望两岸和平交流，两岸人民要有善意、不要恶言相向，回到和平发展的繁荣时期。
此前，萧旭岑3月25日曾召开记者会宣布，马英九将于4月1日至11日参访广东、陕西、北京等地，届时会率领“大九学堂”学员一起前往，参访中华文化历史景点与企业，同时也会出席祭黄帝陵祭典，并将率领青年学子访问中山大学、北京大学，让两岸青年进行交流。
马英九基金会方面介绍，此行团员有马英九、萧旭岑、马英九办公室主任王光慈、台湾政治大学荣誉教授邱坤玄，一同随团出访的20名“大九学堂”青年学子。