然而，政府的乐观态度并没有得到所有人的赞同，科学家、渔民、公共组织及邻国都表示决策过程不透明，没有考虑利益相关方的意见。
甚至日本国内也没有达成共识
自从日本政府有关将净化过的核污水排放到海洋的计划公开的那刻起，各社会组织就呼吁反对将核废水排放到海洋里，而应考虑并研究出其他方法，比如通过选择更多能存放装有核污水储液罐的地方来解决。还有尽管国际原子能机构事先发布了有关日本核污水排海符合国际安全标准，但日本原子力市民委员会在其“8月23日发布的紧急声明”中继续坚持“ALPS”净化核污水方法是无效的且排放过程很漫长，关于这一点，福岛第一核电站运营商东京电力公司称，整个排放过程可能需要30多年。这一机构还称，这种不环保的排放所需成本高得不合理，总计达1200亿日元，成本包括净化核污水、建造水下排放通道及为挽回声誉和支持渔业的费用。
除此之外，渔民们认为，即使是花钱打击那些对在日本近海捕获的海鲜产品进行“投机买卖”的行为可能也是不够的，赔偿并不能解决问题，政府和东京电力公司必须尽一切努力传播有关产品安全的信息。
邻国的担忧
中国、韩国和俄罗斯从一开始就向日本表达了对排放核污水的担忧。日本政府主要因未经适当协商自行做出这样的决定而受到各邻国指责。8 月初，中国外交部表示，这些国家已经向日方发出了技术问题单。
目前，中国已全面禁止进口福岛产品，韩国和台湾也已对其实施部分禁令。