日本和菲律宾就国防关键条约将举行初步谈判。根据这份文件，双方可在对方境内部署军队，参加培训和其它行动。程序简化协议，或成为该方向第一步但却是相当重要的一步，总体而言，可推动国防协议的快速准备。
日本已与澳大利亚和英国签有相互准入协议，为包括与菲律宾在内的其他国家激活军事合作创下先例。
据日本媒体报道，岸田文雄同意付出努力，向马尼拉提供更多国防装备和技术。这表明，东京有意加强伙伴国的军事力量，以遏制中国在台湾海峡和南海的行动。根据东京谈判结果，两国领导人承诺加紧努力，完成日本向菲律宾提供空域检测雷达系统，并保证相关人员培训。
双方在联合声明中指出，启动提高菲律宾海上护法机构能力项目，在菲律宾巡逻艇上安装日本卫星通信系统，并联合发展菲律宾苏比克湾海岸警备队基地。该基地或将成为日本生产的97米巡逻船驻扎地，将为菲律宾海岸警备队所用。
1992年末，美国空军离开苏比克湾军事基地。看来，日本对这里产生浓厚的兴趣。二战期间，日本入侵并占领了菲律宾。现在，日本利用该国，显示在本地区的军事野心。其中，去年12月，日本自卫队空军向吕宋岛克拉克空军基地派出了2架F-15歼击机，这里是菲律宾在南海地区面向中国的前沿。此外，菲律宾已成为日本继美国和澳大利亚之后第三个派出空军的国家。
俄罗斯独联体国家研究所专家弗拉基米尔·耶夫谢耶夫在接受卫星通讯社采访时指出，日本士兵或再次出现在菲律宾，而此次的借口是为遏制中国提供援助。
他说：“日本领导层急于成为拥有武装力量的国家，而非只有自卫队。其中，以遏制中国为幌子，实际上是想复兴军事政治野心。日本在制造麻烦，企图重返菲律宾，对本地区造成严重问题。谁也不排除，日本在若干年内将加入澳英美三边伙伴关系（AUKUS）军事联盟。这将是东方版北约。”
日本首相岸田文雄在与菲律宾总统会晤时指出，两国将继续加强日本、美国和菲律宾国防领域的合作。不久前，美国实现了在菲律宾四个军事基地部署军队的目标，借口是遏制中国。美国和日本在用“中国威胁论”来吓唬菲律宾，试图在中国周边建立军事基础设施，这不仅是亚洲版北约雏形，而且是想把北约的影响力扩大到亚太地区。专家弗拉基米尔·耶夫谢耶夫认为，对地区安全来说是非常可怕的趋势。
他说：“很遗憾，努力打造东方版北约，不会遭到本地区国家、也包括菲律宾的抵制。但他们应非常谨慎，日本获得进入菲律宾军事基础设施便利，前景上或在本地区建立军事基地，其中包括在菲律宾，这将为菲律宾和中国之间制造麻烦。最终，菲律宾或逐渐卷入中美对抗，而日本将站在美国一边。对菲律宾来说，卷入对抗是非常危险的。”
中国南海研究院副研究员陈相秒认为，不排除日本将在菲律宾设立军事基地。
他说：“自去年起日本已经开始和菲律宾就两方面议题进行磋商，一是类似美菲的访问部队协议，二是建立军事基地。这些都反映出日本有意扩大在东南亚地区前沿军事的常态化部署，而菲律宾是其中很重要的一个方向。虽然此次日菲签署救灾协议，但是日本自卫队将扮演的角色值得怀疑。因为人道主义救援不是只有自卫队才能完成，再加上菲律宾的法律规定他国部队不能在本土进行常态化部署，所以日本这一举动的目的还是非常明确，即向外扩张自己的军事存在。包括美菲《访问部队协议》的作用也是如此。另外，岸田文雄和小马科斯还讨论了未来建立军事基地的议题。事实上早在阿基诺三世政府时期，日本就已经提出了这一设想，不过这其中也存在不少问题。一是日本需要寻求美国的同意，否则菲律宾不可能答应。二是军事基地的位置在哪里，这是很重要的一个问题。三是日本在菲律宾驻军是否会引起东南亚国家的警惕、破坏地区平衡，特别是让中国感到不适。应该说这些都是菲律宾需要考虑的因素，直到杜特尔特政府时期菲律宾的态度都比较谨慎。我认为小马科斯也会对此谨慎处理，只是考虑到菲律宾有自己的独立外交政策，不排除日本军事力量出现在菲律宾的可能性。”
专家陈相秒强调，菲律宾加入美日联盟，对东盟也是先例和严重挑战。
他说：“日本更加强化自己在东南亚地区的军事安全存在，实际上破坏了地区已经建立起来的平衡。日本在菲律宾驻军或建造前沿基地，再加上美国的存在，意味着东南亚形成了以美日联盟为基础或以美西方为主导的地区秩序，这对以东盟为核心的地区安全架构是巨大的挑战。另外 地区局势尤其是海上局势将变得更加紧张。虽然日本每年都会派遣海上自卫队的直升机和驱逐舰到南海，但是一旦在该地区拥有军事基地，日本的军事力量包括空中自卫队、两栖作战部队可能都会与美国展开联合训练，再加上侦察机、雷达等军备部署，特别是针对中国的行动，会导致地区国家间的军事较量逐渐升级。对中菲关系也会造成一定影响。即使菲律宾与日本合作是基于独立自主的外交政策，但是日本与中国竞争的目的性很强，这就导致菲律宾无形之中成为了美国和日本的帮手。另外 可能会引起地区其他国家效仿，比如越南、马来西亚、印尼等。事实上日本不仅与菲律宾开展合作，和越南也有着紧密往来，例如日本海上自卫队频繁访问越南金兰湾等。如果地区越来越多的国家与美日进行合作，将意味着日本在地区的势力进一步扩大，地区力量的平衡也会进一步向美西方倾斜，这显然不利于整个地区政治安全一体化的推进。”
周四在东京还签署了日本向菲律宾提供基础设施贷款协议，农业和技术合作协议。菲律宾总统小马克斯会晤后指出，“我们的战略伙伴关系比之前任何时候都牢固。”