8月20日晚，在莫斯科州奥金佐沃区莫扎伊斯基公路上，一辆汽车爆炸导致杜金娜身亡。俄联邦安全局8月22日宣布，杜金娜被害案的幕后黑手是乌克兰情报部门，执行人为乌克兰公民娜塔莉娅•沃夫克，她于7月23日携女儿来到俄罗斯。据联邦安全局信息，在汽车被遥控爆炸后，谋杀执行人携女儿经普斯科夫州前往爱沙尼亚。
杜金在俄罗斯“第一频道”播放的影片片段中回答了主持人“杀手为何要杀他女儿”的问题。
杜金称：“（杜金娜的死）是为了俄罗斯的理念，为了宗教理念，为了东正教的理念，为了主权理念，为了保护我们的人民、我们的国家。”
这位哲学家指出，凶手的目标正是达丽娅•杜金娜，不是他。
杜金补充称，“一切都是为了杀死她，原则上，凶手没有失手，杀死了她”。