俄外交部发布消息说：
“我们表示，我们认为立陶宛方面的挑衅措施违反了立陶宛承担的国际法律义务，首先是俄罗斯联邦和欧盟2002年签署的关于在加里宁格勒州与俄罗斯其它地区之间过境运输的联合声明，是公开的敌对行为。”
俄外交部称，6月20日，立陶宛临时代办维尔吉尼娅•乌姆布拉谢内被俄罗斯外交部召见。俄罗斯外交部在声明中说：
“鉴于维尔纽斯在未事先通知俄方情况下实行禁止通过立陶宛境内向加里宁格勒州运送大量货物的铁路运输禁令，俄方向立陶宛临时代办发出强烈抗议并要求立即取消这些限制。”
俄罗斯外交部指出，如果立陶宛近期不恢复对加里宁格勒的货物中转运输，俄罗斯保留采取行动保护其利益的权利。
立陶宛铁路公司此前通知加里宁格勒铁路局，自6月18日起，停止一系列受欧盟制裁的货物过境。加里宁格勒州州长安东•阿利汉诺夫表示，加里宁格勒州的渡轮设施能够应付因立陶宛限制过境而出现的新货流。途经立陶宛向加里宁格勒州的石油运输仍在继续，其过境暂不受限制，直到8月10日。
俄罗斯联邦委员会保护主权委员会主席安德烈•克利莫夫此前表示，欧盟必须纠正对加里宁格勒的封锁，否则俄罗斯将放开手脚，以任何手段解决过境问题。他说，北约正假手立陶宛开始封锁俄罗斯的加里宁格勒州，这是对俄罗斯的直接侵略，将迫使其诉诸自卫。