他就台湾局势称：“台湾海峡的和平与稳定对我国和国际社会而言很重要。期待台湾问题通过对话得以和平解决。”关于中国大陆，他称“将推进与同盟国美国的合作，呼吁中方履行作为大国的责任”。日本台湾交流协会主页的数据显示，截至9月在台湾约有1.9万名日本人。于中国国家主席习近平作为国宾访日事宜，林芳正称“不处于协调具体日程的阶段”。关于如何应对有国家正探讨实施“外交抵制”的北京冬奥会，他称“将在合适的时期综合考虑各项情况作出判断，现阶段什么也没有决定”。