近年研究表明，古人类曾与相近人种尼安德特人和丹尼索瓦人杂交。欧亚人的基因组里存在明显比例的尼安德特人的基因，而在澳大利亚和大洋洲居民的基因组里则有丹尼索瓦人的基因。
此前认为，杂交发生在人离开非洲之后，因此非洲土著人并没有其他人种的基因。而新研究结果表明，尽管现代西非人的祖先没有尼安德特人和丹尼索瓦人，但在过去，西非人可能与一种未知的古人种进行过杂交，专家称之为“幽灵人”。美国加州大学洛杉矶分校遗传学家阿伦·杜尔瓦苏拉（Arun Durvasula）和斯里拉姆·山卡拉拉曼（Sriram Sankararaman）研究了西非人的405个基因组，并将其与尼安德特人和丹尼索瓦人的基因组进行了对比。
由于很少发现西非古代人类遗骸，且保存状态极差，所以无法提取DNA，只能寄希望于计算机建模。然而，此项研究结果表明，虽然计算机建模有助于发现某未知人种对现代非洲人基因组的影响，但对现代非洲人遗传变异的研究还是非常不够。