苏丹军队于6月3日清晨开始驱散喀土穆市中心国防部大厦周边场地上的帐篷营地，有报道称，军方普遍动用了枪械。
布尔汉指出，投票箱是登上苏丹执政舞台的唯一方法。
持反对派立场的苏丹医生委员会消息称，在喀土穆驱散帐篷营地的行动中，死亡人数已经超过35人，数百人受伤。
苏丹反对派指责过渡军事委员会非法驱散和平示威活动，并呼吁在全国展开大规模抗议示威，要求军事委员会立即下台。军方则宣称，这次行动并非针对示威者，而是为了拘捕混入抗议人群中的犯罪分子。
4月11日，苏丹军队宣布发动政变，巴希尔总统被软禁。4月12日，阿卜杜勒∙法塔赫∙布尔汉出任苏丹过渡军事委员会主席，解除早前实施的全国紧急状态和宵禁。他还宣布，过渡军事委员会将在最长两年的时间内解散，将权力移交给民选政府。尽管过渡军事委员会做出承诺，但民众仍然持续抗议，他们要求立即组建文官政府，并将所有全权交给新政府。