马来西亚交通部长陆兆福在国会中说，新加坡开始在实里达新机场安装导航设备。机场将接纳涡轮螺旋桨飞机和商用喷气式飞机。机场定位导航系统发出的无线电信号将干扰马来西亚船只在柔佛港水域的航行--水域上空有要降落的飞机穿越。除此之外，新加坡飞机的飞行轨道限制了马来西亚境内新建楼房的高度，并造成噪音污染。
新加坡方面回应马来西亚交通部长时表示，自己"尊重马来西亚的主权"。但它同时对马方打算扩大新山港口水域边界表示严重关切。新加坡认为，这将是马来西亚对新加坡大士岛周边领海主权的侵犯。新加坡交通部长许文远向记者表示，最近两周马方船只不止一次侵入该水域。新加坡对这些未经批准、公然侵犯本国主权、违背国际法的行动表示抗议。
新加坡方面认为，这些行动不利于良好的双边关系，给国际航运造成混乱，导致各方航行和安全风险增加。新加坡交通部长指出，"新加坡愿意根据国际法与马来西亚配合，以友好方式解决这些问题"。
俄罗斯科学院东方研究所专家阿列克谢·德鲁戈夫认为，东盟或许是解决这个问题的平台之一。
他说："这两个国家间一直存在着某种紧张。尤其是在马哈蒂尔上台后，马来西亚开始提醒新加坡，它靠着它的水管生存。新加坡不可能从其他地方获得饮用水。出现了水价摩擦。两国间的紧张将来也会一直存在下去，但我认为，邻里关系注定会让它们寻找可被双方接受的解决方案。我暂时到不夸张目前出现的这种海空域利益冲突。紧张会缓解，两国会在东盟框架内解决这个问题。不久前在新加坡召开的东盟峰会证明，这个平台对解决双边与地区问题是有效的。此外，新加坡是全球范围的重要参与者，它是世界银行与经济中心，是最大的港口。任何同邻国出现的问题，都自然会影响它的形象，有损其利益。"
中国国际问题研究院南太平洋研究所研究员沈世顺认为，问题会通过外交途径得到解决。
沈世顺说："新加坡和马来西亚历史上本是一家，就像一个大家庭中的两个兄弟分了家，独立成为两个国家，双方在一些海域、空域的边界划分的划分上难免存在界限模糊的问题。尽管目前新马双方都在相互指责，一方称对方侵犯了自己的领空，一方称对方侵犯了自己的领海。但是我认为，这个问题不至于会使两国关系恶化，目前的冲突和指责仍在一个可控的范围之内，完全可以通过外交、谈判途径，按照国际法原则解决。我相信，新马两国是一对成熟、理智的兄弟，也都是遵守法纪的国家，不会乱来，现在远没有到对话渠道关闭，冲突不可控的局面。"
然而观察家们注意到，新马双方未能利用最新一次东盟峰会这个平台就供给新加坡饮用水价格问题进行谈判，尽管曾计划这样做。马来西亚是新加坡唯一饮用水供应商。1962年两国签署了相应协议，其有效期截至2061年。
观察家们就此提醒说，在马哈蒂尔上次1981-2003年执政期间马新两国就因海空边界问题发生过严重争吵。例如，1998年时任总理的马哈蒂尔因噪音和污染针对新加坡军机关闭了本国的领空。再早些时候，1980年两国因面积虽小于足球场但具有重要战略意义的无人岛白礁岛主权归属问题发生过冲突。争执在马哈蒂尔执政期间一直没有停止。只是到了2008年联合国国际法庭才解决了这个边界问题--判决有利于新加坡。
察哈尔学会高级研究员、广西民族大学中国-东盟海上安全研究中心主任葛红亮认为，现在出现的这种冲突无需外部仲裁。
葛红亮说："我个人认为，新马两国因这一事件交恶的可能性不大，这主要是两国政策对接的问题所致。马来西亚新盟政府执政以来，新马之间已经在水资源、新隆高铁等领域有多个回合的外交口水战与政策交锋，但相关问题也并未冲击两国关系。因而，我相信，新马两国领导和政策部门会就此展开对话、沟通与磋商解决问题。"
目前新马有关海空域划分出现的分歧，同马来西亚围绕一马发展公司（1MDB）的腐败丑闻有关的微妙问题相互交织。马来西亚知名新闻网站The Coverage发布一条消息，似乎马来西亚前总理纳吉布同新加坡总理李显龙之间存在不正当交易，后者保证新加坡银行支持一马发展公司。接着此条消息被新加坡社交网络转发。新加坡总理李显龙以诽谤为由起诉。然而马来西亚媒体公布有关他牵扯入金融丑闻的消息，显然无助于巩固新马两国关系。