爆炸事件是于11月23日在靖国神社南门建筑群的一个公共厕所中发生的,事件并未造成任何人伤亡。事故发生地严重烧毁,在厕所中发现了小电池和电线,这些材料被认为是雷管的一部分。此前有消息称,警方并没有排除这起事件为恐怖事件的可能,事件很可能是因靖国神社所引起的尖锐争议而造成的。靖国神社中保存着为日本战斗而死的战士名单,但在国外,靖国神社有着非常负面的声誉,因在这些阵亡将士中有一些人是经过东京审判结果而确定的二战军事罪犯。一些日本政府成员及议会代表定期参拜靖国神社,这引起了一些遭受日本侵略的亚洲国家的抗议。
据悉,韩国公民也可能参与了这一事件,但韩国内务部代表最终否认了这一信息。2013年9月,一名韩国人向靖国神社扔出了一个带有易燃品的酒瓶,并被拘留。