据了解，本次比赛按照中国国家体育总局强化体能的要求，预赛成绩前16名选手中，取体能成绩前八名选手进入决赛。体能成绩相同，再按照游泳成绩排名进入决赛。体能测试包括5项，即垂直纵跳高度测试、30米冲刺跑计时测试、引体向上最大次数测试、躯干核心力量测试（4个方位）和3000米计时跑测试。
截至发稿前，微博话题“体能测试”突破4.5万讨论，达到1.7亿阅读量。一些网友认为，对游泳运动员要求跑步成绩，这样似乎不太合理。也有网友表示，体测是可以的，但作为考察标准所占比例不应过高。
微博博主“凉月如眉挂柳湾79”说：“滑天下之大稽，专业运动员不比专业比体能。”
微博博主“康少要做Ironman”说：“测体能没问题，但应该是专项体能。”
微博博主“蝀鯟鶫”说：“矫枉过正。体能可以作为成绩的一部分，但作为决定生死的唯一，确实太过绝对，毕竟体能是为了辅助专业，专业还是要看成绩，可以让体能影响成绩，但决不能用体能决定成绩。”
对此，北京体育大学杨斌胜教授在接受俄罗斯卫星通讯社采访时表示，体能测试的内容和标准应该根据体育项目自身的特点和要求来制定。
“（要明白）出发点、目的是什么？是不是跟实际情况相符合？得根据项目的特点，来制定相关的体能测试。而不是说拿一把尺子把世界都量遍了，那不是实事求是的作风。不要打着科学的态度做一些反科学的事情。”
杨斌胜教授还提出了具体的改进措施：
“首先，游泳运动员要引体向上或者三千米跑，这些到底需要不需要呢？如果说需要的话，它占整个的百分比是多少？这个问题要拿捏好。现在搞得有点绝对，占的比例太大了。再者，不同年龄阶段（的运动员）要有不同的侧重点。要根据项目规律的发展来制定规则，而不是要‘一口吃个胖子’。成年、少年和儿童的侧重点是不一样的，对项目的发展规律要有一个客观的认识才行。”
关于体能测试的争议，中国游泳协会主席周继红在接受《中国体育报》采访时进行解释，她表示，这一竞赛改革的方向会继续坚持下去。
她说：“中国游泳要想全面冲击更高水平，必须基础和专项双管齐下，因此这次全国比赛中增加基础体能测试的目的，就是为了弥补中国运动员的短板，以提高中国游泳运动员在世界上的竞争力。换言之，加强体能、恶补短板的目的是为了鼓励运动员在基础身体能力和专业运动表现上，都能对标世界顶尖水平。我们也将通过本次比赛对体能训练进行认真总结，建立起与游泳项目相适应并紧密结合专项、更加完善的基础体能训练和体能竞赛体系。”
中国国家体育总局2月发布了《体育总局办公厅关于进一步强化基础体能训练恶补体能短板的通知》。通知指出，要坚持“体能是东京奥运会入场券”的选拔标准，持续强化体能训练工作。确定各项目基础体能达标标准，不达标者不得参加奥运选拔
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